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プロテアーゼはタンパク質（ペプチド結合）を分解する酵素の総称（全体）であり、ペプチダーゼはプロテアーゼのなかでも特に小さなペプチド鎖をアミノ酸にまで分解する一部の酵素（下位分類）を指します。
プロテアーゼ（タンパク質分解酵素）は、切断する場所によって大きく2つに分類され、特に末端を分解するものをペプチダーゼと呼ぶことが多いです。
まとめると、
プロテアーゼ…「タンパク質を分解する酵素」の大きなグループ名。
ペプチダーゼ……その中にある、主にペプチドをアミノ酸にまで細かく分解する酵素たちの名前。
簡単に言うと、
タンパク質(プロテイン)を分解がプロテアーゼ、
ペプチド構造(タンパク質一部分)分解がペプチダーゼ🙇
