areはbe動詞、doは一般動詞。
因みに、be動詞の疑問文は、
Are you busy?（貴方は疲れていますか？）
一般動詞
Do you want to play tennis?（貴方はテニスがしたいですか？）
回答
are youとdo youの違いでしょうか？
are youとdo youの違いでしたら、be動詞areを使った疑問文の時はAre you〜？一般動詞を使った疑問文の時はDo you〜？で始まりますよ٩(ˊᗜˋ*)و
疑問は解決しましたか？
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因みに、be動詞はbe原型、are複数形、is単数 です。