幕府=中央政府（国）、藩=地方自治体（都道府県、市町村）で、
天皇は個人、朝廷は天皇が直接政治を行うための組織・機関、幕府は天皇から一定の権限を与えられた人（将軍）が政治を行うための組織・機関。
大雑把ですがこんな感じでしょうか？
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