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ミトコンドリアの由来は好気性細菌、葉緑体の由来はシアノバクテリア。これらが原始的な真核生物に取り込まれたことでそれぞれミトコンドリアと葉緑体になったと言われている。その根拠としてミトコンドリアと葉緑体が、「異質二重膜を持つ」「独自のDNAを持つ」「分裂によって増える」などがあげられる。この考えを共生説といい、アメリカのマーグリスによって提唱された。
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