atは「点」のイメージで、inは「内部」のイメージです。atは単に学校を場所とみている感じで、inは学校の「敷地内で」という感じがします。
基本イメージを解説している動画を貼っておきます。熟語の理解にも繋がると思うのでぜひ時間があるときに見てみてください。
at
https://youtu.be/SMDPSraFfRE
in
https://youtu.be/YJA2IM57kp0
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