Question

エミリ

学校で配られたメチル化酵素(Dam，Dcm)についてのプリントに
「かなりの制限酵素はメチル化Aやメチル化CをAやCと認識できないので、GATCやCC(A/T)GGと二塩基以上重なる場合は切断できないことが起きる。」と書かれていたのですが、「二塩基以上重なる」とはどういう意味か教えてください。

Answer 1

✨ ベストアンサー ✨

安田ヒデ

あまりはっきりした意味が不明ですが、DamはGATCの配列を認識しAをメチル化し、DcmはCC(A/T)GGを認識して２番目のCをメチル化しますので、制限酵素がGATCのうちGAを認識配列の中に持ち、または別の制限酵素がCCを認識配列の中に持つ場合にはそれら制限酵素は認識配列を切断できない場合がある。ということではないでしょうか。GA,CCを２塩基と言っているのではないでしょうか。なぜならメチル化されるのは２塩基目のAとCだからです。次の例で制限酵素の認識配列とDam,Dcmの認識配列と２塩基重なっていますね。

例として（酵素名）AccIII 認識配列TCCGGA (DNAの配列がTCCGGATCならDamメチル化)され切断されない。
(酵素名）ApaI 認識配列GGGCCC (DNAの配列がGGGCCC(A/T)GGならDcmメチル化)され切断されない。

メチル化されても影響されない例；(酵素名）EcoRI 認識配列GGATCC (DNAの配列がGGATCCならDamメチル化)されるが切断に影響ない。
　　　　

エミリ

納得できました！
ありがとうございます。

安田ヒデ

難しいことを習っているのですね。