Question

♪(๑ᴖ◡ᴖ๑)♪

分からないので教えてください

Q. 下記のDNA配列 (A) と短い15塩基のDNA (B) と (C) とを混ぜてPCR 反応を行った場合、優先的に増幅されるDNA断片
の長さは何塩基対であるか?
(Aの配列には数え易い様に10塩基毎にスペースを挿入してあります。)
(A) 5'- GACCCCGCTG AAAGGCCACA AGCGCTTCTG CCGCTGGAAA GACTGCCACT AAATGCAAGC
TGATCGTGGA CCGCCAGAGA CTAGTCGAAC GTAAAGCCTC -3'
(B) 5'- AAAGGCCACAAGCGC -3'
C) 5'- TTTACGTTCGACTAG -3'
回答群
25 塩基対 ② 40塩基対 ③ 45塩基対 ④55塩基対 ⑤ 70塩基対 ⑥ 85 塩基対

Answer 1

✨ ベストアンサー ✨

けー

添付しましたように、(B)の配列は赤枠の部分と一致して、(C)の配列は青枠の部分の相補的(AとT、GとCが対になる）な配列と一致します。
赤枠から青枠までの文字数が８５文字ですので、(6)が答えになると思います。
もう少し詳しい説明があったほうが良いでしょうか？

♪(๑ᴖ◡ᴖ๑)♪

ありがとうございます。なぜ赤枠から青枠の範囲が優先的に増幅されるのでしょうか？

けー

教科書や資料集のPCR (Polymerase Chain Reaction)の項目に詳しい説明があると思いますので、ここでは簡単に説明してみます。添付した図を見ながら読んで下さい。

PCRは、長いDNA鎖の中で目的の部分を増幅する方法です。
使うのは、問題文の(B)や(C)のような短い配列のDNA鎖（プライマーと呼ぶ）と、DNAポリメラーゼという酵素です。
DNA鎖には5'と3'という向きがあり、DNAポリメラーゼは5'から3'の方向にしかDNA鎖を合成して伸ばしていくことが出来ません。そして、DNAポリメラーゼは、部分的に二本鎖になっている所にしか乗っかることが出来ません。
ですので、
温度を上げて二本鎖をほどき、一本鎖にする
=> 少し冷ますと、鋳型のDNA鎖にプライマーがつく
=> プライマーがついた所にDNAポリメラーゼが乗っかり、そこから3'方向にDNA鎖を伸ばして二本鎖にする
=> 温度を上げて二本鎖をほどき、一本鎖にする
を何十回と繰り返していくと、２つのプライマーがくっつく間の部分が優先的に増幅されることになります。

これで分かると良いのですが。。。

♪(๑ᴖ◡ᴖ๑)♪

ありがとうございます！理解できました！