非常に個人的な感覚ですが、
クロマトと一言で言っても、何種類もありますが、概して似通った物質の分離に使うと思います。
抽出や再結晶を検討した後で採られることが多いかと思います。(いきなり最初からということは、薄層クロマトを除いて、無いかと。)
媒質や充填材との相互作用のわずかな違いを利用して分離するので、上手くするとしっかり分離できますが、その有効な組み合わせの選択で悩まされることが多い方法です。その意味で前処理、前準備が重要になってまいります。
ざっくりですが、こんな感じで説明になっているでしょうか。
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詳しく説明していただきありがとうございます!!!!