1. goは自動詞ですが、自動詞を受動態の形で使うと、受け身にはならず、完了の意味を表します。are goneはhave goneと同じ意味を表し、「死んでしまった」ということになります。
2. as soon as、whenなどで時を表す副詞節を作ると、内容が未来のことでも現在形で表します。だから、will arriveとしないでarrivesとなります。
回答
1番は絶滅したって意味になるので、行ってしまった(もういない)の意味があるgoneになります。
forever があることからも、(もう永遠にいない)と考えれば意味が通じると思います。
2番はarrives の主語が目の前のitなので、三人称単数のsが必要です!
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