上は普通の疑問文で、彼の秘密を知ってるかもしれないし知らないかもしれないし、という考えがあって質問しています。
下は、おそらく彼の秘密を知らないだろう、という考えが頭にあって質問しています。「あなたは彼の秘密を知らないよね？」という感じです。
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