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put ~ back to - -に~を戻す
where it was それがあった場所
the placeの省略が起きています(先行詞の省略)。本来は
(the place) where it was
the placeもwhereも名詞的に扱えば似たような意味だしどっちかなくてよくね？といった感じで、the placeは省略されるのが常となっています。
when you're through with it
あなたがそれを読み終わったとき
throughの通り抜ける、といった意味から派生して、最初から最後まで通す、といったような意味もあります。ここでは本を最後まで終わらす、という意味です。
ちなみにwhenも本来は
(at the time) whenという形でした。
詳しい解説、ありがとうございます😊
理解できました！！