Question

アン

生物のバイオテクノロジーです
答えは5番なのですが、センス鎖とか鋳型とか頭の中でごっちゃまぜになってしまうので考え方を教えて欲しいです!

ちなみに問題の(3)はPCR法です

とある細菌の遺伝子の塩基配列の一部を下に示す。 これは非鋳型鎖(センス鎖)の
塩基配列である。塩基配列の上の数字は,各塩基が図中の5′末端から何番目かを表
している。この配列の1番目から48番目の塩基配列部分のDNA を ( 3 )により増
幅するため, 12 塩基の長さのプライマーを用意することにした。この実験に用いる
二つのプライマーの組合せとして適切と考えられるものを次の選択肢の中から一つ
選べ。 (4点)
30
5-GCCGAAATGCGTACCGGTGAAGGAAAAACCCTGACCGCAACGCTGCCT-3
(3)
5′ - CGGCTTTACGCA-3′と5'-AGGCAGCGTTGC-3′
5′ -TCCGTCGCAACG-3′ と 5′ - CGGCTTTACGCA-3′
5′ -CGGCTTTACGCA-3 と 5-GCCGAAATGCGT-3′
4 5'-GCCGAAATGCGT-3'25'-TCCGTCGCAACG-3'
⑤ 5'-GCCGAAATGCGT-3' 5'-AGGCAGCGTTGC-3'
6 5'-AGGCAGCGTTGC-3'25'-TCCGTCGCAACG-3'
①
2
CCA t

Answer 1

✨ ベストアンサー ✨

谷米

大事なのは5'→3'の向きにのみ増えるということです。

左側については、5'から書かれているとおりそのまま、つまりGCCG...
右側については、図示されているのは3'側なので、相補鎖を考えて、右から(相補鎖の5')側から読んでAGGC...

という感じで伝わるでしょうか…

アン

向きを考えればいいのですね!
相補的な配列にならないのはなぜなのですか？

谷米

そもそもDNAは2本鎖なので、相補鎖も存在しています。
この図に相補鎖を書くとしたら、相補鎖の方は左側が3'なので、そちらからは増やせない…という感じでしょうか。
もしよくわからないようでしたら、後で図をお送りします。

アン

すみません図お願いします🙏💦

谷米

こんな感じでどうでしょう。
DNAは2本鎖。下線部の領域を含むようなプライマーを設計しようとすると、四隅にプライマーをつけられそうな感じがします。

ただ、実際には（1）DNAは5'→3'の向きのみで伸長する、（2）DNA2本鎖は逆向きのDNAによって構成されている、この2つから、写真の下のようなプライマーだと想定と逆向きに伸びてしまうため使い物になりません。

また、選択肢のプライマーの配列は5'→3'の向きで書いてあるため、赤いプライマーはそのままでいいですが、青いプライマーは右から左に読む必要があります。

アン

とても分かりやすいです!
丁寧な解説ありがとうございました🙇‍♀️