そこは多分誰しもが1度は疑問に思うポイントですよね。
例えば
H2O + 2q =2H + O (qはH-O間結合エネルギー)
みたいな式を反応式に代入してみてください。
-反応物の結合エネルギー = -生成物の結合エネルギー + Q、と結合エネルギーにマイナスがかかるためご存知の式になります。
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 ̄ヽ、 _ノ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄ ̄
`'ー '´
○ と思うラッコ
O であった
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三{ 人∴三 }
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