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絶対値の中身が"正の数"or"負の数"で場合分けをします。
例えば
│−1│=1では
│−1│=−(−1)=1
という計算がされています。
一方で、
│+1│=1では
│+1│=+(+1)=1
という計算です。
2つを見比べてみると絶対値を外す時に、
中身がマイナス→カッコの前にマイナスを付ける
中身がプラス→カッコの前にプラスを付ける
(そのまま外す)
という作業が行われています。
今回の場合では
│x^2-a^2│の絶対値の中身が正か負か分からないので
正の場合と負の場合で分ける必要があります。